抗病毒药物很多，药物结构不同，产生的副作用也不相同，不同抗病毒药治疗疾病不同，有的可能终生需要服药，所以使用时一定在医生的指导下结合自身情况，选择合适的药物治疗，具体如下:
1、常用的是抗流感病毒药，如金刚烷胺和金刚乙胺，使用时可能会引起的副作用有腹痛、头晕、高血压或体位性低血压。2、神经氨酸酶抑制剂如奥司他韦，口服可引起疲乏、精神异常、抽搐、感冒症状、喉头水肿等。
3、利巴韦林可引起肾损害，严重时可引起急性肾衰竭、尿毒症、骨髓造血功能抑制、贫血、白细胞，或粒细胞计数减少等。
4、抗疱疹病毒药如阿昔洛韦、恩替卡韦等，常见的副作用有一过性血肌酐、尿素氮升高、血尿、蛋白尿、骨髓造血功能抑制、白细胞计数减少等，还可以出现中枢神经系统症状，如精神异常紧张等。
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