手足口病与疱疹性咽峡炎的区别，就是疱疹性咽峡炎除了口腔之外的皮肤，并没有相关的皮疹，包括丘疹和疱疹。手足口病除了咽峡部的疱疹、丘疹之外，还可以出现在手上、脚上、屁股上，甚至其他的皮肤部位。疱疹性咽峡炎并没有其他部位的皮疹，如果有皮疹称之为手足口病，其他方面二者一样。疱疹也可以指其他的疾病，像水痘-带状疱疹或者其他引起疱疹的疾病，与手足口病之间的差别比较大。手足口病身上的皮疹大部分是红色的丘疹，有比较严重的可能出现明显的疱疹，但是有一些轻的甚至可以不出现疱疹，所以手足口病与导致疱疹形态的疾病的差别比较大。
