引起龟头隐隐作痛的原因如下几种：
1、龟头隐隐作痛可能是龟头炎导致的，比如平时不注意个人卫生，就会导致细菌、真菌、滴虫等感染，造成龟头炎的发生，龟头部位就会出现红肿、疼痛，甚至还会出现红斑的症状。
2、尿道炎、膀胱炎、尿道结石，也会导致出现龟头隐隐作痛的症状，当炎症刺激尿道，龟头部位就会导致尿频、尿急、排尿疼痛、龟头疼痛的症状。
3、包皮过长的患者也会引起龟头疼痛，包皮过长时，长期覆盖住龟头部位导致包皮腔内清洗不当，容易形成包皮垢，包皮垢长期刺激龟头部位，就会造成龟头疼痛的症状。建议平时要多喝水、多排尿，还要做好局部卫生，出现包皮过长的患者应尽快进行手术切除。
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