卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，子宫内膜异位症的患者不育率可以达到40%。引起不孕的原因比较复杂，比如盆腔微环境改变影响精卵结合及运送，免疫功能异常导致抗子宫内膜抗体增加而破坏子宫内膜正常代谢及生理功能，卵巢功能异常导致排卵障碍和黄体形成不良等原因，都是有可能导致不孕的。子宫内膜异位症治疗的根本目的是缩小和去除病灶，减轻和控制疼痛，治愈和促进生育，预防和减少复发。医生会根据患者的年龄、症状、病变部位和范围，以及对生育的要求制定个体化的治疗方案。
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