舌头根部淋巴滤泡增生的原因主要如下：
1、慢性咽炎和扁桃体炎的患者咽部舌根处有大量淋巴组织，在炎症时就要参与免疫引起舌根部的淋巴滤泡增生；
2、如果下颌的后牙有牙髓炎、根尖周炎、牙周炎或者智齿冠周炎，会引起的感染会蔓延到舌根，引起舌根淋巴滤泡增生；
3、疱疹病毒感染导致的病毒性咽峡炎，引起咽喉处出现水疱和溃烂，也会导致舌头根部淋巴滤泡增生；
4、由于病毒感染、真菌感染或者化学机械的刺激，使舌头根部的轮廓乳头发炎，导致舌根乳头红肿、疼痛，可伴有淋巴滤泡增生；
5、后牙牙尖尖锐或者有不良修复体，总是咬伤或者刮伤舌根导致舌根出现溃疡，也会引起舌根淋巴滤泡的增生。
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