长期服用阿司匹林，会有消化道的症状，如嗳气、胃部胀痛不适。通常是因为阿司匹林抑制胃底黏膜系统，称为COX(环氧化酶)，导致胃黏膜保护效力下降。部分严重的患者，会有消化道出血等问题。但目前大部分患者服用的是肠溶阿司匹林，对胃黏膜的刺激性较小。
如果出现胃炎、胃溃疡等情况，通常是因为患者合并幽门螺杆菌感染。既往有胃溃疡、十二指肠球部溃疡等消化道疾病，也容易导致患者出现阿司匹林不耐受的情况。对于这类患者，临床上会预防性使用PPI制剂，即质子泵抑制剂，防止阿司匹林对胃黏膜的损伤。改用肠溶阿司匹林，也可以迅速减少长期服用阿司匹林后，对胃、消化道系统带来的不良副作用。总体而言，服用阿司匹林对于冠心病、动脉粥样硬化的患者，获益大于胃肠道的不良反应。
