单纯疱疹病毒2型常常引起的疾病叫生殖器疱疹，感染以后出现泌尿、生殖器，以及肛门周围皮肤黏膜出现的一种常见性传播疾病，常呈慢性或者反复发作过程，且通常难以彻底治愈，其典型表现为生殖器部位出现红斑、水疱、疼痛、刺痒，甚至严重时可以见到溃疡。一般在最初感染的时候，病毒会在身体中而处于休眠状态，当自身免疫力抵抗力下降时被激活。
生殖器疱疹症状因人而异，大多数感染单纯疱疹病毒患者，往往没有任何症状或者体征，或因为症状太轻，以至于没意识到是疱疹表现。有症状者主要在生殖器周围出现水疱、糜烂、溃疡，还可有瘙痒和灼热刺痛感，在最初期可能会出现类似于流感样症状，比如发热、头痛、肌肉酸痛等。
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