嘴唇上火起疱一般情况下是由于疱疹病毒所引起的，选择抗病毒治疗，常用的药物有阿昔洛韦、伐昔洛韦、更昔洛韦，也可以选择病毒唑，也就是利巴韦林，常规情况下可以使用阿昔洛韦软膏进行局部涂沫。如果水疱消退以后产生破溃，可以涂抹促进愈合的药物，例如曲安西龙软膏、重组人表皮生长因子凝胶，或者可以使用外用溶液，可以促进其快速愈合。不使用药物一般也能自愈，在7-15天左右能够自愈，建议提高机体抵抗力，这样才能促进水疱的消退，并且能够避免复发。
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