乙肝病毒变异之后呢会出现多种表现，第一个，检测表面抗原是阴性，但是检测乙肝的DNA却提示有乙肝病毒的感染，是由于乙肝病毒变异后表面抗原不能被现在广泛使用的试剂所测出。第二个，疫苗免疫预防失效，有一些变异的乙肝病毒对于使用的疫苗或者是中和抗体失效，导致母婴传播阻断失败。第三种，可能会发生一些重度的表现，如暴发急性肝炎、重症肝炎，有一些病人如果前C区突变，可能会引起慢性肝炎的恶化或肝移植失败，还有一些人出现基因部位的变异，导致拉米夫定耐药出现，拉米夫定失去治疗作用。
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