睡醒有眼屎，主要由以下原因导致：
一、少量的眼屎一般是眼睑的脂质分泌，属于正常现象。
二、细菌性结膜炎，细菌性结膜炎是眼科常见的疾病，包括超急性、急性或亚急性、慢性结膜炎，共同特征是分泌物增多，分泌物可为脓性、黏脓性或浆液性。最常引起脓性分泌物的病原体是淋球菌，患者早晨起来可以表现为睁眼困难、大量眼屎。
三、病毒性结膜炎，病毒性结膜炎是一种由病毒所引起的结膜炎，常可以合并水样分泌物，当继发细菌感染时，也会出现黏脓性分泌物。
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