转氨酶如果超过两倍正常值，大多都属于病理性的转氨酶升高，病理性的转氨酶升高需要明确病因，对因治疗。病毒性肝炎、酒精性肝病、脂肪性肝病、药物性肝损伤、代谢性肝病以及自身免疫性的肝病都会导致肝功能异常、转氨酶升高。
如果是由于乙肝感染导致的转氨酶升高，需要进行抗病毒及保肝治疗，推荐的抗病毒治疗药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效的抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化的发展。另外，由于脂肪肝的发病率也逐年升高，发现转氨酶升高可能是由于脂肪肝引起，对于脂肪肝的患者，建议低脂饮食，配合运动来改善肝功能。
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