生理脱毒阶段是最痛苦的阶段，一般需要的时间为1-2左右。
生理脱毒阶段是第一阶段，也是最为痛苦、最危险的阶段，患者通常可以采用，比如冷火鸡法、梯度戒毒法、替代递减脱毒疗法，还有中医药的方法来帮助吸毒者顺利度过生理脱毒的戒断反应期，一般要经过1-2周。吸食毒品量大、持续时间长的人可能需要超过2周、3周或者更长。生理脱毒阶段第一步随后要进入康复阶段以及后续照管阶段，如果患者只是经历生理的脱毒，后面如果没有连续性的戒毒过程，复吸率非常高，可以达到90%。
患者也可以自身调节戒毒的症状，比如可以让自己的生活更加规律、参加一定的社会活动、从事一定的工作，分散自己的注意力，不用让自己总去关注自身的不适感觉，也可以减轻症状。
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