牙根黑了可以进行以下治疗：
1、牙颈部及牙根部出现黑色结石时，可以通过超声波洁治和龈下刮治去除结石及病变骨质，清理肉芽组织后进行牙周冲洗。
2、牙周萎缩暴露的牙根面发生龋坏时，可以使用球钻磨除腐坏牙体组织，使用玻璃离子水门汀或复合树脂进行充填。
3、牙颈部长期存在楔状缺损，发生继发龋时，在修补后需要纠正不良的刷牙姿势。
4、牙髓坏死、牙齿发黑时需要进行根管治疗，摘除感染牙髓，完成根管充填，最后制作全冠修复。
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