多囊主要由内分泌异常和代谢异常而导致的。内分泌的异常包括黄体生成素和卵泡刺激素的比例增大、雄激素过高、雌酮过多。代谢的异常主要是胰岛素抵抗和胰岛素数值比较高。另外，环境因素里包含肥胖以及遗传因素，对患者也是比较重要的。内分泌异常的作用机理主要是由于黄体生成素比较高，卵泡刺激素比较低，这个时候就会导致排卵障碍，影响卵泡发育，患者会出现不排卵的情况。由于雄激素增高，女性会出现月经稀少、闭经、月经量减少的临床表现。另外，由于雄激素增高，少数患者会出现多毛、痤疮等临床表现。
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