院内获得性肺炎常见的致病菌有铜绿假单胞、肺炎克雷伯、流感嗜血杆菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎球菌以及凝固酶阴性葡萄球菌，这些细菌有些是环境菌，有些是异位菌，也就是本来应该在肠道的现在进入呼吸道，也就是致病了。还有些是寄生菌，一般不引起疾病，但是免疫力下降以后就可以致病。引起院内获得性肺炎的诱因，也就是易患因素主要是年龄比较大，另外肺部的慢性疾病，比如免疫力低下、营养不良以及意识障碍、长期应用抗生素、侵入性操作、长期住ICU、外科手术、鼻饲管、制酸剂应用、长期卧床等等都是诱因。
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