尿路感染在临床看到95%以上是由单一细菌引起的，其中90%的门诊病人和50%左右的住院患者，其病原菌是大肠埃希杆菌，此菌的血清分型可高达140种，致尿感型大肠埃希杆菌与病人粪便中分离出来的大肠埃希杆菌同属一种菌型，多见于无症状菌尿或无并发症的尿感，而变形杆菌、产气杆菌、铜绿假单胞菌以及粪链球菌等等，见于再感染，留置导尿管或者有并发症致尿路感染者。白色念珠菌、细菌链球菌感染多见于糖尿病以及使用糖皮质激素和免疫抑制剂药的病人以及肾移植后。金黄色葡萄球菌多见于皮肤创伤及吸毒者引起的菌血症和败血症。病毒、支原体感染，在临床上虽少见，近年来，有逐渐增多的趋势。
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