新生儿出生时缺氧会有什么样的后遗症要根据新生儿出生时缺氧的严重程度，以及缺氧的时间而决定。一般轻度窒息，如出生以后Apgar评分在4-7分之间，新生儿往往在生后72小时之内症状就消失，所以一般不会留下神经系统的后遗症。
如果新生儿在出生以后有重度窒息，如Apgar评分在0-3分之间，同时伴有神经系统的症状，如昏迷、惊厥、吃奶差、反应差，并且持续一周以上，症状不能缓解，往往会在新生儿期后留有神经系统的后遗症，最常见的后遗症有继发性的新生儿癫痫、新生儿智能发育异常，以及生长发育落后，严重的可能会发生脑瘫，大部分新生儿窒息都是以轻度为主，预后往往比较好。
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