流行性腮腺炎实际上是全身性感染，病毒经常累及中枢神经系统或其他腺体和器官而产生症状，某些并发症不仅常见，而且可以不伴有腮腺肿大单独出现。第一、神经系统并发症，常包含三种，1、无菌性脑膜炎、脑膜脑炎、脑炎。2、多发性神经炎、脊髓灰质炎等。3、耳聋。第二、生殖系统的并发症，腮腺炎病毒好侵犯成熟的生殖腺体，故多见于青春期后期以后的患者，比如睾丸炎、卵巢炎。第三、胰腺炎，胰腺炎大约见于5%的成人患者。第四、肾炎。第五、心肌炎。第六、其他，乳腺炎、骨髓炎、肝炎、肺炎、前列腺炎、前庭大腺炎、甲状腺炎、胸腺炎、血小板减少、荨麻疹、急性滤泡性结膜炎等均较少见，关节炎发生率为0.44%，主要累及肘、膝等大关节。
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