新型冠状病毒肺炎患者如果出现腹泻时，除了基础疾病的治疗之外，可以给予对症治疗，应用一些止泻的药物，而且要注意水电解质平衡。腹泻的次数、持续的时间及严重程度，目前报道不一，但是有文献报道，腹泻可以作为预测重症患者的独立危险因素。所以出现腹泻时，要高度重视是否病情有种重症化的趋势。
目前较为一致的意见认为具有潜在抗病毒作用的药物应在病程早期使用，建议重点应用于有症状高危因素，即有重症倾向的患者，所以出现腹泻时可以使用抗病毒的药物治疗，可以使用α干扰素雾化吸入，还有利巴韦林、磷酸氯喹和阿比多尔。使用药物的疗程均不应该超过10天，而且不建议同时应用三种以上的抗病毒药物，在抗病毒药物治疗期间，要注意药物的不良反应。
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