手足口病是由一组肠道病毒感染所引起的急性的传染性病毒，病原体多种多样，但是都是肠道病毒属的RNA病毒，属于小RNA病毒科。其中引起手足口病的肠道病毒常见的有肠道病毒71型、柯萨奇病毒以及埃可病毒的某些血清型。病毒对乙醚、去污剂等有比较强的抵抗力，但是对紫外线比较敏感。对多种的氧化剂，比如高锰酸钾、含氯的消毒剂、甲醛、碘酒等，都比较敏感，病毒会很快地被灭活。病毒在50℃的时候可以被迅速地灭活，在4℃的时候可以存活1年，-20℃的时候可以长期保存。对于手足口病病原的理解，有利于对疾病更好的控制。
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