在临床上通常把女性的生殖器官称为子宫以及附件，附件包括输卵管和卵巢，子宫附件囊肿就是输卵管或者是卵巢的囊肿。在临床上输卵管和卵巢的囊肿统称为附件囊肿，包括输卵管的积液、积脓等囊性的病变，也可以发生输卵管的囊性肿物。
附件囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，卵巢的生理性囊肿最常见的是没有破裂的卵泡或者是黄体囊肿，会随着月经周期的变化而自然的消失，所以严格意义上讲，生理性的囊肿不是真正的囊肿。
另外一种就是病理性的囊肿，病理性的囊肿分为良性囊肿和恶性的囊肿，良性囊肿最常见的是卵巢的巧克力囊肿、输卵管的炎性囊肿和单纯囊肿，也包括卵巢的浆液性囊肿、黏液性囊肿，另外就是卵巢的恶性囊性肿瘤。
鉴别生理性囊肿和病理性囊肿主要是借助于影像学的判断和与生理周期的关系来鉴别。病理性的囊肿常常是依据于影像学的特点、肿瘤标记物以及临床的症状，金标准是病理组织学的检查，子宫附件囊肿就是发生于输卵管或者是卵巢的囊性病变的总称，叫附件囊肿。
