疱疹性咽峡炎，主要是由肠道病毒感染引起的急性传染病，而最常见的是柯萨奇病毒感染。疱疹性咽峡炎可发生在任何年龄段，但好发于1-7岁的患儿，由于患儿不注意卫生，或者在幼儿园处于聚居状态等原因，容易被传染到该疾病。当患者抵抗力下降时，接触受到柯萨奇病毒感染患者，或者接触到处于潜伏期状态的患者后，病毒可直接经由肠道或呼吸道传播。1-7岁的小儿，呼吸道黏膜柔嫩，呼吸道免疫功能差，呼吸道自洁功能差，当受到病毒感染后，容易发病。
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