磁共振(MRI)头颅平扫对小孩没有副作用。部分小孩有头部症状，如头晕或者经常恶心、头昏脑胀，医生会建议做磁共振扫描，家长会担心检查对人体有伤害、有辐射。从科学角度来讲，磁共振扫描对儿童或者任何人不会有损伤或者辐射，因为磁共振的原理是利用磁场产生信号进行采集，最后得出图像，并不是像CT一样，利用X线穿过人体得到图像，所以磁共振检查没有辐射损伤。
有些小孩可能不适合做头颅磁共振，如年龄较小不能配合，这时可能需要服用药物镇静处理。体内有金属植入物的小孩，如内固定患儿，则不适合做磁共振，可能会带来其它损伤。
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