甲硝唑和替硝唑都是用于治疗厌氧菌的硝基咪唑类抗菌药物，两者抗菌谱相似。
但是甲硝唑唑和替硝唑的主要区别在于：
1、甲硝唑是第一代硝基咪唑类抗菌药物，替硝唑是新一代的硝基咪唑类抗厌氧菌药物。
2、替硝唑的抗菌活性比甲硝唑强，副作用比甲硝唑低。替硝唑半衰期长，血药达峰时间短，生物利用度高，1日1-2次给药即可；甲硝唑口服后，血药浓度维持在12小时，一般需每天3次给药。
3、替硝唑的不良反应较甲硝唑少见且轻微，偶有头痛、头晕、皮肤瘙痒、恶心、呕吐等。
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