激光治疗由于穿透性比较强，对于深部的组织或者皮肤表面，可能会产生热量，如果能量控制不好的情况下，有可能使软组织出现烧灼伤的可能性，尤其是深部的软组织烧灼伤之后，有可能会导致深部的软组织出现坏死、感染的情况。另外，如果激光是用来做碎石的情况下，尤其是用于治疗肾脏或者输尿管的结石，有可能会损伤肾脏或者输尿管的软组织。对于凝血功能差的病人，如果用激光治疗，有可能会导致其毛细血管出现破裂、出血，导致皮下瘀斑，严重的还有可能会导致皮下血肿的形成。
