HPV疫苗注射第一针和第二针大概间隔是1-2个月，HPV疫苗需要三次注射，第二次注射在第一次注射以后的1-2个月以后。第三次注射在第一次注射后的至少半年，或者第二次注射后的4个月以上。是否接种第三针由医生来决定，一般9-14岁的青春期女孩子可以只接种两次。但是如果只接种两次的青春期女孩子，第二次注射必须在第一针后的6-12个月。
HPV三针注射的过程中如果接种程序受到打断，不需要重新开始第一次的注射。疫苗的注射采用肌肉注射的办法，首选接种的部位是上臂的三角肌。HPV疫苗有三种，二价疫苗、四价疫苗和九价疫苗，这三种疫苗都需要注射三次。
