扁平疣是因为感染人乳头瘤病毒引起的。扁平疣的产生过程主要是当机体感染了人乳头瘤病毒后，病毒侵入增生性的基底上皮细胞，导致患者皮肤出现病理变化，棘层细胞产生角化过度，并出现异常的增生，促使表皮层异常肥厚，从外表可以看到突起的疣体，这就是扁平疣。如果患者搔抓，皮肤损伤容易出现自身的接种传染，感染病毒的概率增大，并可以迅速扩散，如果免疫力低下并且发生外伤，也是扁平疣的好发因素。此外，直接接触传染也是扁平疣产生常见原因之一，主要通过皮肤黏膜的小破损，病毒极容易进入细胞内部，诱发上皮细胞产生了异常的分化、增生，最终可出现上皮良性的赘生物。
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