龟头正常的颜色是粉红色或者鲜红色，偶有发青。但变黑通常是由体内的黑色素水平所致，黑色素沉着会出现龟头变黑。黑色素的水平跟遗传有一定相关性。此外，随着年龄的增加，黑色素沉着会越来越多，龟头也会相应地变黑。
若反复出现龟头的感染炎症，因为反复炎症的刺激，也会导致黑色素沉着速度加快，导致龟头的颜色变黑。部分患者认为性生活太多、摩擦多以后龟头会变黑，其实没有明确的理论依据。很多患者的性生活频率很高，但龟头颜色仍然偏粉红，没有变黑。
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