尿路感染用药的时间长短要根据具体病情来决定，如果是对于单纯性膀胱炎，可以选用敏感的抗菌素，首选3日疗法。对于症状持续1周或者更长时间，可能具有复杂因素的病人，可以选用7日疗法。对于慢性膀胱炎，疗程应该适当延长，发作期最好用药7日以上，并且应该根据细菌培养结果来选择敏感的抗菌素，同时还要解决容易造成慢性炎症的因素。
对于上尿路感染，往往急性的伴有全身症状，严重时甚至可以引起败血症，疗程也相应要延长，如急性肾盂肾炎，静脉用抗生素疗程需要1-2周。在体温正常、临床症状改善，尿细菌培养转阴后改为口服维持，也应该2周以上。因此同为尿路感染，部分患者用药3天即可，而部分用药甚至要长达1个月以上。
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