怀孕初期吃避孕药不一定会影响胚胎发育，尤其是口服紧急避孕药以后却发现怀孕的情况。因为在受精卵着床以前，口服药物对胚胎发育的影响是全或无的关系，也就是受精卵着床以前，口服药物对胚胎的影响是完全流产或者不会对胚胎发育有任何影响。
当然，如果精子与卵子本身发育有异常，或者有染色体核型异常等情况，当受精卵形成以后也可能出现胚胎发育畸形。所以怀孕初期一旦使用药物，女性需要按期进行孕检，及时排除胎儿发育畸形、妊娠及并发症情况。
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