支原体和衣原体的感染都有可能导致不孕，但并不是所有的支原体或者所有的衣原体。支原体中的解脲脲原体、人型支原体、生殖支原体等可以感染人，造成男性精子质量的下降，也可以感染女性造成输卵管炎或者子宫内膜炎。输卵管炎反复发作就有可能导致不孕，输卵管炎如果导致了粘连，就更加有可能导致不孕的出现。如果是在妊娠期间感染了某些支原体，甚至能够导致流产或者影响胎儿的生长发育。女性如果感染了沙眼衣原体，出现了宫颈炎、子宫内膜炎或者输卵管炎，与不孕或者异位妊娠也有关。但并不是所有的支原体都可以导致不孕，如果是肺炎衣原体、肺炎支原体感染，与不孕没有太大的关系。
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