做纤维支气管镜一般情况下没有后遗症，但有时会出现咳血、感染等相关并发症。如果患者出现少量的咳血是正常的，无需处理。如果患者出现了明显的咳嗽、咳黄痰、发热等症状时，临床上不除外致病微生物的感染，应该积极就医，进一步完善相关检查来明确诊断，对致病微生物进行评估，并根据致病微生物的不同采取相应的治疗。例如患者是因为细菌感染出现的呼吸道症状，可根据病情给予抗生素的治疗，轻者可口服抗生素，重症者可静脉抗生素。如果患者出现了支原体、衣原体等非典型致病菌的感染，可使用大环内酯类抗生素或者是喹诺酮类抗生素。
