引起疱疹性咽峡炎常见的病原菌有三大类：一、病毒；二、细菌；三、支原体。小儿在引起疱疹性咽峡炎时通常会有发热，伴有咽峡部疱疹、疼痛等表现，治疗上根据引起的病原菌进行治疗，同时给予对症治疗。
如是病毒感染可给予应用抗病毒药物进行口服或者静脉输液，如是细菌感染可给予头孢类或者青霉素类抗生素进行治疗，如是支原体感染可给予应用大环内酯类抗生素进行治疗。在疾病期间可给予应用开喉剑喷雾剂喷于咽颊部疱疹处，可以明显缓解疱疹的疼痛，以及促进疱疹的愈合。疾病期间一定要多喝水、清淡饮食，有利于疾病的恢复。
