链霉素可以作为以下几大类疾病的首选用药：第一、感染类的疾病，例如泌尿系统感染、消化系统感染、盆腔和腹腔内的感染，通常可以用作急性胃肠炎、胆囊炎、胰腺炎、阑尾炎等首选用药，还可以用在泌尿系统，对于急性膀胱炎、急性前列腺炎、妇科用药都可以作为疾病的首选用药。第二、非感染性的疾病中也可以作为首选用药，对于结核菌素的杆菌感染，例如肠结核、肺结核、鼠疫杆菌感染、布氏杆菌感染，都有很强的抗杆菌的感染作用。第三、链霉素还可以用作冲洗，例如盆腔、膀胱冲洗以及外伤后的刀口冲洗，都可以作为首选用药。
