碘缺乏病的症状并不相同，主要取决于缺碘的程度、年龄，以及个体对缺碘的反应性、适应能力。在新生儿期如果碘缺乏，可以导致婴幼儿死亡率增加，发生地方性克汀病，可以表现为智力落后、聋哑、斜视、黏液性水肿、体格矮小、神经运动功能发育落后、新生儿甲减，以及新生儿的甲状腺肿。
在儿童和青春期如果碘缺乏，可以出现甲状腺肿、青春期甲减、智力和体格发育障碍、性功能发育障碍、单纯的聋哑。在成年期如果缺碘，就会导致甲状腺肿及其并发症、甲减、智力障碍、典型的甲亢。
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