感染人乳头瘤病毒通常使用抗病毒的治疗方法，也可以使用抗病毒配合免疫调节剂治疗。可以使用免疫调节剂，如干扰素、卡介菌多糖注射液肌注治疗，调节人体免疫功能；也可以使用口服药物，如转移因子或者胸腺肽增强人体免疫功能。人体免疫功能恢复后，人乳头瘤病毒会被自动清除，身体逐渐恢复。
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