紧急避孕药在性生活后72小时以内服用有效，并且越早服用避孕效果越好，如果超过72小时通常失败率较高。紧急避孕药是通过干扰卵巢的排卵功能，干扰受精卵的着床，改变宫颈局部黏液的性质，进而阻止精子进入子宫，再通过子宫进入输卵管与卵子结合形成受精卵。紧急避孕药通过上述渠道，改变女性的内分泌结构，达到避孕的目的。
但是由于紧急避孕药是高效效价的孕激素，可能影响内分泌环境，所以如果反复、过量使用可能导致闭经、不孕、排卵功能障碍等不必要的身体损伤。通常只是在没有采取安全有效的避孕防护条件下或避孕失败的条件下，72小时之内采取的补救措施。通常服用紧急避孕药＜2次/月、＜3次/年，否则会对身体造成不必要的损伤。
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