射精时伴有刺痛，可能有以下几种原因：
1、生殖道感染，最常见的为精囊炎、射精管周围炎、前列腺炎，炎症可以导致以上部位充血、水肿，射精时导致局部充血、水肿加重，引起射精疼痛。
2、精道结石，精囊或射精管结石阻塞，也可以引起射精疼痛。
3、尿道炎，尿道炎症波及精阜周围，可以导致射精时疼痛。
4、手淫或性生活过度，精道及后尿道反复充血，也可以导致射精疼痛。
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