急性阿米巴痢疾的治疗可以分为一般治疗、病原学治疗，具体如下：
1、一般治疗：急性期的患者需要进行卧床休息，给予流质或者少渣的饮食。慢性患者需要加强营养，忌食用辛辣刺激性的食物，腹泻严重患者要适当补液，以纠正水电解质紊乱。而重症患者要给予输液、输血，加强支持治疗；
2、病原学治疗：如甲硝唑、奥硝唑、替硝唑等硝唑类药物一般杀菌作用比较强，副作用也比较少。另外像吐根碱，对溶组织内阿米巴滋养体有一定的杀灭作用。卤化喹啉类药物也对肠内阿米巴滋养体有杀灭作用，该药一般不会单用，需要配合前面几类药物进行联合抗菌治疗。
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