奥司他韦通过抑制神经氨酸酶，可以抑制成熟的流感病毒脱离宿主细胞，从而抑制流感病毒在人体内的传播，以起到治疗流行性感冒的作用，但临床上没有不能治疗咳嗽。
如果患者确诊为甲流等相关的病毒性感染时，可以考虑使用奥司他韦，如果患者出现咳嗽，可使用止咳的药物，例如复方甘草片、肺力咳合剂、舒黄止咳胶囊、右美沙芬，喷托维林等等。同时完善相关检查，评估可能感染的致病微生物，并做出针对性的治疗，例如患者出现了C-反应蛋白、白细胞的升高，此时考虑为细菌感染，需要使用头孢丙烯、阿奇霉素等相关的抗生素进行治疗，必要时可给予静脉抗生素治疗。如果患者出现病毒感染导致的咳嗽，可以给予对症止咳治疗，因为病毒一般有自限性。如果患者的支原体、衣原体、军团菌抗体在近期升高4倍以上，此时考虑为非典型致病菌引起的咳嗽，可使用阿奇霉素、红霉素或者左氧氟沙星、莫西沙星等相关的药物进行治疗。咳嗽的患者禁止使用高糖、高盐的食物，这些食物可能会导致咳嗽症状加重，同时避免过度劳累，避免吸入刺激性的气体等等。
如果患者出现了有痰咳不出，可使用祛痰的药物，咽痛明显时可含服金嗓子含片、胖大海含片，咳嗽明显时可口服止咳的药物。患者咳嗽或打喷嚏时用纸巾遮住口鼻，将纸巾丢进垃圾桶。
