并非所有试管婴儿均为双胞胎，仅相较于自然妊娠而言双胎几率略高。试管婴儿是否为双胎与移植胚胎数目、胚胎着床数目以及胚胎分裂有关。通常情况下移植两个胚胎有双胎几率也有单胎几率，也有无胚胎着床而导致妊娠失败的情况。过往对于胚胎移植的数目控制不严，多数患者会选择移植双胚胎，甚至对于35岁以上的女性而言还可以移植三胚胎，从而导致多胎几率明显升高。
但多胎妊娠对孕妇和胎儿均有较大风险，可能增加早产、低体重儿出生概率，于孕妇而言则会增加产后出血以及妊娠期并发症的风险。因此为降低多胎妊娠产生的危害，如今我国甚至世界范围内均积极推行单胚胎移植策略，尽量减少胚胎移植数目。各生殖中心质量控制目标也逐渐定为足月单胎分娩，尽量避免双胎出生。
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