肝管癌的晚期主要的症状包括，肝功能损害的症状和黄疸的症状。晚期的肝管癌病人会合并有不同程度的转氨酶增高，以及恶心、呕吐、厌油腻、腹胀、腹痛、腹泻等消化道的症状。
这些症状的出现是由于晚期肝管癌对肝细胞的破坏，造成肝功能的异常导致。如果肝管癌晚期的病人堵塞了肝管，引起梗阻性的黄疸，这时候尿色可以呈深黄色，大便颜色变浅，周身皮肤可以深黄色、黄绿色，伴有周身皮肤的瘙痒。
