新型冠状病毒肺炎的确诊需要根据流行病学史、临床表现，以及实验室检查进行确定。流行病学史指发病前14天内有武汉市及周边地区，或其他有病例报告社区的旅行史或居住史，发病前14天内与新型冠状病毒感染者有接触史，发病前14天内曾接触过来自武汉市及周边地区，或有来自病例报告社区的发热，或有呼吸道症状的患者，聚集性发病，两周内在小范围，如家庭、办公室、学校、班级等常出现两例及以上发热和(或)呼吸道症状的病例。临床表现发热和(或)呼吸道症状，具有上述新型冠状病毒肺炎影像学特征，发病早期白细胞总数正常或降低，淋巴细胞计数正常或减少，有流行病学史中的任何一条且符合临床表现中任意两条，无明确流行病学史，符合临床表现中的三条，被认为是疑似病例。
确诊病例是疑似病例同时具备以下病原学或血清学证据证据之一者，如：
1、实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性。
2、病毒基因测序与已知新型冠状病毒高度同源。
3、血清新型冠状病毒特异性IgM抗体和IgG抗体阳性，血清新型冠状病毒特异性IgG抗体由阴性转为阳性，或恢复期较急性期4倍以上升高，所以新型冠状病毒肺炎的实验室检查，主要包括核酸检测、病毒基因测序和血清冠状病毒特异性抗体的检测。
