最主要的神经递质包括多巴胺和乙酰胆碱，多巴胺与乙酰胆碱两大递质系统在纹状体中功能相互拮抗，两者之间的平衡对基底节运动功能起着重要的调节作用。如果平衡被打破，则可出现锥体外系疾病的症状。
帕金森病中纹状体多巴胺递质水平显著降低，可造成乙酰胆碱系统功能相对亢进，这种递质失衡与皮质、基底节、丘脑、皮质环路活动紊乱，肌张力增高、运动减少等运动症状的产生密切相关，中脑边缘系统和中脑皮质系统的多巴胺水平显著降低是智能减退、情感障碍等高级神经活动异常的基础。
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