防疫站检测艾滋病也是先进行艾滋病的初筛，如果初筛阳性，再进行确认试验，确认试验阳性，才可以作为艾滋病的诊断依据。确认试验就是检查艾滋病的HIV抗体，HIV抗体阳性可以作为诊断的依据。
艾滋病有一个窗口期，窗口期目前认为是14-21天，所以推荐感染HIV后的第六周进行抗体检测，因为在第六周，有80%的人可以产生HIV抗体，在12周时，100%的人会产生HIV抗体。如果过早进行检查，会出现假阴性，所以有高危的情况时，如果早期检测HIV抗体是阴性，也不能完全排除没有HIV感染。
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