甲胎蛋白定量偏高可能是原发性肝癌所导致的。原发性肝癌的甲胎蛋白高是指甲胎蛋白>400ng/mL，或者是200ng/mL持续两个月以上，才能达到原发性肝癌的诊断标准，轻度的升高可能是肝硬化、肝炎所导致的。如果甲胎蛋白>400ng/mL，同时伴有B超、CT、磁共振等影像学检查，发现肝脏有占位性病变，可以确诊为原发性肝癌。原发性肝癌是不需要做病理穿刺检查的，80%左右的原发性肝癌甲胎蛋白是明显升高，达到肝癌的诊断标准也有少数的肝癌甲胎蛋白可以不升高。
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