败血症没有最佳治疗时间，确诊败血症之后，尽早开始有效的抗菌治疗是治疗败血症的关键。
败血症的抗菌治疗要根据药物敏感试验选择抗菌药物，在未获得病原学资料前可进行间歇性的抗菌治疗。经验性治疗是根据患者年龄、原发疾病、免疫状态以及病原菌的可能入侵途径等推测病原菌种类，结合当地病原菌耐药流行情况，针对性地选用抗菌药物。原发感染在肺部多为肺炎链球菌或流感杆菌所致，可选用青霉素、半合成青霉素或第一代头孢菌素等。原发感染在膈肌以下都为革兰氏阴性细菌所导致，可选用第三代头孢菌素等本身内酰胺类的抗菌药物。免疫力低下者，败血症多为超广谱内酰酶的革兰氏阴性细菌所导致，可采用第三代头孢菌素与酶抑制剂的联合制剂或广谱的碳青霉烯类的抗生素进行治疗，待药敏结果出来后再根据结果决定是否进行治疗方案的调整。如果能够及时用药治疗，大多数感染者都能够彻底治愈，败血症的平均病死率在30%-40%左右。
败血症患者出院前应接受正确的健康教育，了解败血症的预防和护理知识。保持皮肤黏膜和口腔清洁，预防交叉感染。
