肺炎支原体的感染其根治的办法，重点在于予以有效的抗感药物治疗，其疗程一定要足，只有彻底的杀灭肺炎支原体，才能治愈肺炎支原体感染，以及由其引起的相应疾病，例如肺炎支原体通常可以感染呼吸系统形成支原体肺炎，还可以感染泌尿系统引起尿路感染，此时选择敏感的抗感染药物，例如左氧氟沙星、莫西沙星、阿奇霉素、多西环素抗感染治疗。对于肺炎支原体引起的肺炎患者，通常需要两周左右的抗感染时间，而对于尿路感染的患者，通常需要三周左右的时间，但具体的时间，还需视疗效以及病情的严重程度来进行决定，通过有效的、足疗程的抗感治疗，肺炎支原体感染都能根治。
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