CT检查优点就是检查快速，尤其是对于不合作和躁动不安的病人，给予一定的镇静剂可以快速成像。对于脑出血、颅骨骨折显影清楚，相对于磁共振检查价格低，缺点是对人体有一定放射线伤害。磁共振检查检查较慢，病人只要稍微活动就会影响成像质量，对于身体内带有金属物品，幽闭恐怖症者不适合做核磁共振检查。对于脑出血和骨折病人，磁共振检查阳性率不高，但对于脑干、小脑病变的检查具有优势，价格较CT贵，对人体没有放射线伤害。磁共振可以多个层面检查，如轴位、冠状位、矢状位，CT只能是轴位，所以相对于CT，磁共振检查病变更清楚。
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