急性和亚急性心内膜炎的主要区别是感染的细菌不一样，急性心内膜炎感染的细菌是金黄色葡萄球菌，而亚急性心内膜炎感染的细菌往往是链球菌。如果两个细菌进行比较，金葡萄球菌更严重，所以金葡萄球菌感染的急性心内膜炎更重。亚急性心内膜炎的病程比急性心内膜炎稍慢，但是二者感染的病变都是一样的，都是心脏的二尖瓣或者主动脉瓣。细菌、细菌代谢产物以及脓性细胞会沉积在心脏的瓣膜处，导致心脏瓣膜出现关闭不全或者出现菌血症，这个病只能进行手术治疗。
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